【東大&日立スパコン】ヒトゲノム解析を10倍の速度で

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1: Mogtan ★@\(^o^)/ 投稿日:2015/03/26(木) 23:47:42.37

掲載日:2015年3月26日
http://www.zaikei.co.jp/article/20150326/242464.html

東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センターは26日、日立製作所と協力して、ヒトゲノム解析用
スーパーコンピュータシステムを刷新し、「Shirokane3」として4月1日から本格稼働すると発表した。

Shirokane3は、従来システムと比べ約10倍の速度でヒトゲノム情報の解析が行えるうえ、大容量の
ストレージ装置により従来システム比約33倍の約100万人分のデータを保存することができる。

今回の稼働により、膨大なデータからヒトゲノムが変異した箇所を高速に検索・特定し、ヒトゲノム変異と
疾患要因の因果関係の分析や、治療効果の高い医薬品の予測を行うことが可能となる。東大医科研
ヒトゲノム解析センターは個人のヒトゲノムの特徴に応じたがんや感染症などの予防・診断・治療法の
研究を加速し、個人の特性に応じた個別化医療の実現を目指している。(坂本直樹)

<画像>
スーパーコンピュータシステムShirokane3のイメージ(日立製作所の発表資料より)
http://www.zaikei.co.jp/files/general/2015032614162191big.jpg

<参照>
ニュースリリース:2015年3月26日:日立
http://www.hitachi.co.jp/New/cnews/month/2015/03/0326.html

Shirokane3 運用開始のお知らせ | ニュース | ヒトゲノム解析センター
http://hgc.jp/japanese/news/2015/03/shirokane3_1.html

引用元: ・【医学/スパコン】東大など、ヒトゲノム解析を従来比10倍の速度で

21: 名無しのひみつ@\(^o^)/ 投稿日:2015/04/28(火) 05:39:10.47 ID:gNeAZvvG.ne
>>1
フラッシュメモリ 120TiB、ハードディスク 12PiB、テープアーカイブ 21PB
モンスターストレージだな

2: 名無しのひみつ@\(^o^)/ 投稿日:2015/03/27(金) 00:04:31.80 ID:Cu06owyl.ne
むかしちょこっと関わったなぁ
別の機関だけど

3: 名無しのひみつ@\(^o^)/ 投稿日:2015/03/27(金) 00:19:28.51 ID:ezpwe1fL.ne
国民全員のDNAを記録保存すれば、社会保障費が減ると思う。
つまり遺伝子タイプで将来罹患する病気やある薬が効果が出るかどうかが分かる。
地頭の程度や犯罪性向も分かるので、不要な人間を社会から排除できる。

4: 名無しのひみつ@\(^o^)/ 投稿日:2015/03/27(金) 00:28:27.91 ID:1nRZHYde.ne
>>3 在日の排除だけで 充分

5: 名無しのひみつ@\(^o^)/ 投稿日:2015/03/27(金) 07:16:19.36 ID:6MastMZk.ne
>>4
だな

6: 名無しのひみつ@\(^o^)/ 投稿日:2015/03/27(金) 23:32:42.41 ID:5PurDZIj.ne
チョンゲノムを解析したらヒトとどれくらい一致しているのか知りたい

7: 名無しのひみつ@\(^o^)/ 投稿日:2015/03/30(月) 07:58:08.58 ID:tYg3A8gZ.ne
>>6
99%位は一致してるっしょ!

8: 名無しのひみつ@\(^o^)/ 投稿日:2015/03/30(月) 17:18:50.22 ID:dbH9bPQ5.ne
この手の技術はこれまでの人種差別を遺伝子差別に置き換えた
新たな社会問題を引き起こすだけであろう。アーリア人の遺伝子
を持たないものは、害悪であるから、辺境の地に追いやり家畜と
同様の生活をさせるようにすれば良いとかいいだしかねない。
あたかも、エホバ神がアダムとイブをエデンの園から追放されたように。

14: 記憶喪失した男@\(^o^)/ 投稿日:2015/04/26(日) 17:26:59.74 ID:95hb/abF.ne
>>8 日本の遺伝子解析会社が祖先解析してくれないのは、やっぱり遺伝子差別が起こる可能性があるからかなあ?

9: 名無しのひみつ@\(^o^)/ 投稿日:2015/03/30(月) 17:53:46.11 ID:QBAMz22+.ne

MtDNAしか持たない場合も人種の詳細が分かるようになるかな

とりあえずお疲れではなく、繋がりがより詳細と出るようになるわけだ

10: 名無しのひみつ@\(^o^)/ 投稿日:2015/03/30(月) 21:54:43.60 ID:SMwky6ii.ne

古代日本列島人の核ゲノム解析
http://www.jstage.jst.go.jp/pub/pdfpreview/asj/122/1_122_122.117.jpg

長野県湯倉洞窟出土縄文早期人骨(mtDNA D4b2)、青森県尻労安部洞窟出土縄文中期人骨(mtDNA D4h2)、
福島県三貫地貝塚出土縄文晩期人骨(mtDNA N9b,M7a2)から抽出した核ゲノムを解析

日本列島3集団(アイヌ,本土日本,琉球)と縄文人を用いた主成分分析の結果、
縄文人と遺伝的に類似の集団は見られず、遺伝的に非常に特異な集団であることが明らかとなった。
また、縄文人集団間の地理的・時代的な大きな遺伝的差異は見られなかった。
このことから、今回解析した青森,福島,長野を含む東北周辺の縄文人は、時代を通して、互いに遺伝的に類似の集団であった可能性がある。
しかし、本解析は現代人に見られるSNPを用いた解析であり、縄文人固有のSNPは含んでいないことからバイアスを含んでいる可能性がある。
縄文人と同一のSNPを共有する頻度を解析した結果、日本列島3集団が、北京の漢民族よりも多くのSNPを共有していた。
またその頻度は、アイヌが最も高く、琉球がその次に高かった。

http://ir.soken.ac.jp/?action=repository_uri&item_id=4960&file_id=19&file_no=1
http://ir.soken.ac.jp/?action=repository_uri&item_id=4960&file_id=19&file_no=2

11: 名無しのひみつ@\(^o^)/ 投稿日:2015/04/25(土) 00:02:14.53 ID:W+g41v++.ne
興味深い結果が出た

12: 名無しのひみつ@\(^o^)/ 投稿日:2015/04/25(土) 02:02:03.45 ID:uBGmLnX2.ne
国民のDNAを全て解析して、データベースに登録して、
品種改良に使うのですね。ウェルズがタイムマシンで予言
したような社会が実現するわけですな。

13: 名無しのひみつ@\(^o^)/ 投稿日:2015/04/25(土) 19:10:19.84 ID:ZN9BZGvv.ne
プラチナデータ的な展開ですねわかります

15: 記憶喪失した男@\(^o^)/ 投稿日:2015/04/26(日) 17:47:06.89 ID:95hb/abF.ne

日本人を信じてください。

日本の会社で祖先解析やりましょうよ。Y染色体の解析を。

縄文系だろうと渡来系だろうと、日本人は日本人ですよ。
日本人を信じてください。祖先解析、大規模にやりましょう。

16: 名無しのひみつ@\(^o^)/ 投稿日:2015/04/26(日) 18:01:42.04 ID:0Iyssbax.ne
夢はあるが大した血筋じゃないと悲しくなるよな

17: 記憶喪失した男@\(^o^)/ 投稿日:2015/04/26(日) 18:22:06.33 ID:95hb/abF.ne

おれも今、祖先解析を頼んでるんだけど、
結果がもうすぐ出るはずなんだけど、

百姓の出なのはまちがいないのに、源氏なんじゃないかって夢ばかり考えてる。

18: 名無しのひみつ@\(^o^)/ 投稿日:2015/04/26(日) 18:39:32.51 ID:0Iyssbax.ne
>>17
沖縄のDは被検者全員が源氏由来と言われている
裏を返せば沖縄の土着ではなく由来が本土のD

20: 記憶喪失した男@\(^o^)/ 投稿日:2015/04/26(日) 19:07:15.45 ID:95hb/abF.ne
>>18 いや、ぼくは沖縄を開拓した人たちがもともと源氏を中心としていたんじゃないかと思ってるよ。

19: 名無しのひみつ@\(^o^)/ 投稿日:2015/04/26(日) 18:55:56.41 ID:0Iyssbax.ne

途中だった

天皇や武士に交わらないDと源氏を由来とする沖縄のDを比較すると
華族士族沖縄論議が虚しくなりそう

22: 記憶喪失した男@\(^o^)/ 投稿日:2015/05/10(日) 17:49:43.60 ID:C7LEyv6T.ne

やっほー。

祖先解析キットを買って、祖先を調べたぜよ。
結果、Y染色体ハプロは、O1b2*(旧O2b*)だということがわかった。

おいらは、生粋の弥生人だ。よろしくな。

23: 名無しのひみつ@\(^o^)/ 投稿日:2015/05/10(日) 22:01:17.31 ID:fNil3Plm.ne
台湾の遺伝子は大陸系統で、沖縄の遺伝子は日本由来って結果や
ハブのいる島といない島が交互に点在してる事を考えると
島が水没したり隆起したりしてるんだよな。
つまり人が住んでなかった地域だったって事だ。
そして北から移住して来た。

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